反相色谱柱：使用新的C18柱时，先用甲醇或乙腈冲洗20-30个柱体积，然后用甲醇/乙腈：水（50:50）冲洗10个柱体积，然后再用流动相平衡10-30柱体积。

　　正相色谱柱：新柱用流动相平衡20-30个柱体积。

　　离子色谱柱（SAX,SCX）：新柱先用100%甲醇或乙腈冲洗20个柱体积，然后转换到流动相平衡。

　　部分品牌的氨基柱和氰基柱是保存在正相流动相中，用于反相色谱时，先用异丙醇或乙醇冲洗色谱柱50-100个柱体积。

　　当用HILIC模式时，新柱用50倍柱体积50/50乙腈/水活化平衡，然后再用流动相平衡20个柱体积。